2012年1月7日土曜日

生物学的ネットワークへのグラフ技術の応用

[GEXF] Diseasome: 既知の障害遺伝子との関連によって結び付けられた障害/疾患遺伝子のネットワークで、多くの疾病の遺伝的原因が示されています。類似する障害に関連する遺伝子では、生成物質間の物理的相互作用発生の可能性が高いと当時に、転写の発現プロファイリングの類似性も高いことが示されています。オリジナルデータセットはここにあります。The Human Disease Network, Goh K-I, Cusick ME, Valle D, Childs B, Vidal M, Barabási A-L (2007), Proc Natl Acad Sci USA 104:8685-8690
[GEXF] C. Elegans の神経網: C. Elegans (線虫の一種) の神経網を表した、重み付けされた有向ネットワーク。D. Watts と S. Strogatz によって作成されたデータは Web から入手することができ、ここにあります。引用時には次の出典を明記してください: D. J. Watts and S. H. Strogatz, Nature 393, 440-442 (1998)。オリジナルの実験データの出所: J. G. White, E. Southgate, J. N. Thompson, and S. Brenner, Phil. Trans. R. Soc. London 314, 1-340 (1986).
[GEXF] イースト: イースト菌のタンパク質間相互作用。オリジナルデータはここにあります。
[訳注:原文に欠落部分があるようです]オリジナルデータはここにあります。

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